Coronaviruset (SARS-CoV-2)

Som ni kanske sett så har Socialstyrelsen meddelat att det är de som har anvaret för statistiken kring covid-19. Här visar de statistiken - https://www.socialstyrelsen.se/statistik-och-data/statistik/s...

Tydligen skiljer den sig något från den statistik Folkhälsomyndigheten sammanställt.

https://www.svt.se/nyheter/inrikes/socialstyrelsen-hittar-fle...

"När Socialstyrelsen analyserar sin statistik över dödsorsaker upptäcker de fler avlidna i covid-19 än Folkhälsomyndigheten rapporterar. Det framkom vid måndagens presskonferens om pandemiläget i Sverige. Vi hittar ungefär tio procent fler personer än vad som har framkommit hittills i Folkhälsomyndighetens uppgifter, säger Mona Heurgren, avdelningschef vid Socialstyrelsen."

Var ett tag sen jag läste relevanta kurser för detta och har väl hållit mig till enklare modellering när jag är på jobbet, med någon variant på SARIMA skulle kanske vara något där man kan få med en säsong i modellen också?

Annars fanns denna sida på wikipedia som SIR och liknande modeller som används inom epidemiologi: https://en.wikipedia.org/wiki/Compartmental_models_in_epidemi...
Problemet med den modellen är väl att dS/dt alltid är <= 0 vilket innebär ett slut i modellen. En tanke skulle kanske vara att man kan föra in en avtagande immunitet så dS/dt beskrivs av dS/dT = -B*I*S/N + R/T_immun?
Blir ju något mellanting mellan SIS och SIR isåfall.

En tanke kan vara att socialstyrelsen jämför personnr och har fått in fall som inte finns registrerade hos FHM medans de fortfarande väntar på en del av de fall som FHM har fått in. Annars ser det ut som ett stort misstag.

SARIMA (eller någon snarlik variant) har jag använt och det känns rimligt. Men att få ihop SARIMA med SIS och SIR ställer till det för mig då jag inte har tiden/kompetensen att lösa det snabbt. Jag är lite för otålig kanske.

Jag började läsa på om https://www.repidemicsconsortium.org/ och https://www.reconlearn.org/ redan i januari! Men, orkade/hann inte fullfölja. Fast då jag lagt ned mer tid än jag borde kanske jag... Hur man använder det beskrivs här - https://www.reconlearn.org/slides/projections/projections.pdf Åter ett "men", det är för korttidsprojektioner, inte återkommande epidemier.

Man får hoppas att det inte är ett misstag. Ingen behöver fler misstag just nu.

Ja Covid 19 drabbar folk extremt olika, det är väldigt märkligt. Att unga friska överlever och äldre svårt sjuka dör är inget märkligt egentligen, men när unga friska dör och gamla sjuka överlever inser man (eller snarare inser inte) hur lurigt detta viruset är.

Låst artikel, men i dagens Ystads Allehanda skriver dom om Bertil 83 som överlevde viruset.
Bertil har hjärtsvikt, nedsatt immunförsvar (pga. gammal cancerbehandling) och är 83 år, så på pappret borde han ha gått bort när han var inlagd på intensiven här i Ystad, men han överlevde behandlingen och har nu fått komma hem till sin fru igen (som även hon blev sjuk, dock inte lika hårt drabbad).
Väldigt kul nyhet nu i Coronatider, men samtidigt är det märkligt.

Det borde ju vara fler; antalet som testat positivt plus antalet med enbart klinisk diagnos borde ju vara större än antalet som testat positivt.

Fast jag fick intrycket av att socialstyrelsens siffror bara inkluderar dödsfall där covid-19 av läkare angetts som (primär) dödsorsak. Man kan ju testats positivt för viruset utan att ha det som dödsorsak. Jag tror vi kommer få en korrektion på PK i eftemiddag

Om du plockar bort eftersläpningarna som FHM lagt dit sedan 23/4 hur ser det ut då?

Ja påkörd av en buss när man testat positivt dagen innan ställer ju till det beroende på hur det rapporteras!

Så här ser det ut om jag tar FHM:s värden nedladdade 21 april på eftermiddagen och jämför FHM med SOC. Det är totalt drygt 5 % mer hos FHM än hos SOC fram till 20 april.

Fortfarande märkligt.

Tydligen har FHM publicerat felaktiga siffror igen i helgen.

https://emanuelkarlsten.se/04/folkhalsomyndigheten-drog-tillb...

@Jumpcut: Gissar på att han bor i Portugal med tanke på hans plats-beskrivning under hans avatar och ville visa hur det är där han bor jämfört med Sverige?
Vild gissning bara ifrån min sida dock, så jag kan ha fel.

Ah, det har du nog rätt i. Dock känns det inte så relevant. Olika förutsättningar, olika sätt att rapportera etc?

@Jumpcut: Jo, lite random var det allt

Här kommer uppdateringar för gårdagen.

Data kommer från worldometer.info och Folkhälsomyndigheten. Data har presenterats både som absolutvärden och relativa värden samt med linjär och logaritmisk y-axel. Derivatan har beräknats enligt ett tidigare inlägg, men där lutningen nu är baserad på sju dagar för att spegla en arbetsvecka samt minimera effekter från dygnsvis variation. Diagrammen är gjorda i Google kalkylark och med trendlinjer som är centrerade tredagars rullande medelvärden. Det är totalt nio diagram, och jag visar här de två sista. Klicka på Visa innehåll för att se de resterande.

Vad vi ser i diagrammen är andraderivatorna, som visar "styrkan" eller hastigheten i förändringarna. Det nedre diagrammen är per miljon invånare så folkrika länder syns inte lika tydligt.

Men, vi ser att Sverige har tydligast nedgång sett per capita, så något rätt måste vi ha gjort.

Visa innehåll

Dold text

Ja det är hur olika det drabbar folk som jag också tycker är det sista stora orosmomentet. Tycker det mesta tyder på att dödligheten kommer vara ganska låg på sista raden. Kommer mer och mer rapporter som stödjer detta. Men just att fullt friska människor hamnar i respirator borde ge alla en tankeställare.

//J