timeshift är inte avsett för backup då det bara duplicerar filer som ligger på systemroten (/). Med filsystemet btrfs så kopieras inte ens filerna utan flaggas som spökbackuper som enbart tar upp utrymme på precis så mycket som ändrats. timeshift är endast avsett att användas för att kunna rulla tillbaka till en föregående uppdatering. Trashar disken på något annat sätt där du inte kan starta OS så måste du ändå installera om.
En korrekt backup utförs med rsync (CLI), eller grsync (GUI frontend) om man känner att man fortfarande behöver en napp i munnen. rsync /grsync kan även hantera filerna över andra diskar samt även till andra datorer över dess demon.
rsync kan hantera backuper efter vissa kvalifikationer som storlek, checksumma, ändrade tider och man kan välja vilka attribut man tar med sig. Oförändrade filer kopieras inte. Det går även att säkerhetskopiera filer som uppdateras och man kan även provköra (dry run) för att få ett resultat av vad som händer med körningen utan att något genomförs. Då kan du se om det finns problem som exempelvis hinder i rättigheter. Du kan även välja om du ska köra med förhöjda rättigheter som rootanvändare.
Från grsync kan du grafiskt skapa det kommando som sedan kan köras som CLI.
Se följande manualer i terminalen (skriver du in alla kan du läsa dom en efter en varje gång du trycker "Q"):