Hej!
Kan det vara något program/bakgrundstask som spökar?
Jag har själv märkt att när jag har f.lux igång på kvällarna så får jag input lag på musen, har inte alltid varit så men kom förmodligen efter någon uppdatering till programmet.
Använder själv Logitech GPW och märker att jag har lite extra input lag när Logitech Gaming Software är igång i bakgrunden så nu har jag bara igång programmet om jag behöver ändra någon inställning i musen och sen stänger jag av det helt.
Om ingen av de ovannämnda hjälper så hade jag kört någon slags uteslutningsmetod i aktivitetshanteraren. Stäng av alla program/processer i aktivitetshanteraren som möjligt samt inaktivera program från autostart som inte behövs och se om problemen löser sig.
Lycka till!