Kopiera filer i Windows 7

Jag har en hårddisk för program och en hårddisk för lösa filer. Hårddisken för program är dynamisk. Jag vill ändra den till basic, vilket innebär att jag måste formatera den. Således kopierar jag över hela programdiskens innehåll till en mapp på fildisken. När jag sedan jämför innehållet är det inte identiskt. Antalet filer och mappar stämmer ej. Hur är det möjligt?

Nästa steg i planen är att formatera programdisken i ett annat OS, och kopiera tillbaka filerna i det OSet från fildisken, därefter starta upp 7 igen och köra på som vanligt. Men, det förutsätter att kopieringen är riktig. Jag minns att detta varit ett problem som funnits hur länge som helst i Windows, men jag har aldrig förstått vad det beror på.