Om du kör mjukvaruraid så behövs inget särskilt moderkortsstöd. Rekommenderar mjukvaruraid ändå oavsett vad moderkortet har för stöd. När det gäller TDP vet jag inte men du kan ju kolla lite på silentpcreview och i forumet där för folk brukar nästan tävla i att bygga så strömsnålt som möjligt och de gör mätningar på hur mycket det drar i verkligheten.
En annan grej är att kolla på hur mycket din tänkta processor drar i vila (för en NAS står oftast och gör ingenting). Det är inte säkert det lönar sig att skaffa en processor med låg TDP eftersom TDP mer gäller maximal effekt och för en NAS är det mer intressant att veta hur mycket den drar obelastat. Dagens processorer är väldigt bra på att klocka ner sig själva för att spara ström och skillnaden är mindre än man tror mellan olika processorer.
Själv köpte jag begagnat till min NAS (eller filserver som jag hellre kallar den). Blev ett AM3 moderkort och en Athlon II 640 (det var något år sedan). Betalade 700 kr för moderkort + cpu... Eftersom man ändå ska klämma in massor av hårddiskar tycker jag inte det är så viktigt med mini-itx för chassit blir ofta ganska stort ändå i slutändan. Beror väl också på vad du ska göra med din NAS men ska du bara dela ut filer så funkar det med billigaste prylarna man kan hitta. Jag prioriterar många SATA-platser, många kortplatser för att kunna ansluta framtida kontrollerkort, tv-kort eller vad man nu kan önska sig i sin server. 4 minnesplatser för att kunna trycka i mycket RAM (mycket RAM ger stor filcache vilket är bra för prestandan). Kanske ECC-minnen också.
Köpte ett enligt mig perfekt moderkort häromdagen. Begagnat Gigabyte GA-970A-UD3 för 300 kr. Med det har man stöd för virtualisering och ECC-minnen vilket är bra för en server. Nytt kostar det under 800 kr. Men det blir väl inte lika strömsnålt som du vill ha det. Men typ en FX-6300 drar inte jättemycket ström i idle men mera än intel i full last.
http://www.xbitlabs.com/articles/cpu/display/fx-8350-8320-630...
Men antar att du helst vill ha intel och mini-itx.